Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP25Q9UHP3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
USP25Q9UHP3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
USP25Q9UHP3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms