Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms