Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SHPKQ9UHJ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SHPKQ9UHJ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SHPKQ9UHJ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms