Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO40Q9UH90 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FBXO40Q9UH90 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXO40Q9UH90 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO40Q9UH90 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms