Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDKN2A-AS1Q9UH64 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDKN2A-AS1Q9UH64 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms