Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FAM8A1Q9UBU6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM8A1Q9UBU6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM8A1Q9UBU6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms