Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DNAJB11Q9UBS4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAJB11Q9UBS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAJB11Q9UBS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms