Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HDAC6Q9UBN7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDAC6Q9UBN7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HDAC6Q9UBN7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms