Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNG4Q9UBN1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CACNG4Q9UBN1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CACNG4Q9UBN1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms