Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPARGC1AQ9UBK2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPARGC1AQ9UBK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPARGC1AQ9UBK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms