Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00474Q9P2X8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00474Q9P2X8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms