Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CPSF2Q9P2I0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CPSF2Q9P2I0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CPSF2Q9P2I0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms