Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABI3Q9P2A4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABI3Q9P2A4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABI3Q9P2A4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABI3Q9P2A4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABI3Q9P2A4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABI3Q9P2A4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABI3Q9P2A4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms