Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC88CQ9P219 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC88CQ9P219 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC88CQ9P219 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms