Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCHIP1Q9P0W5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCHIP1Q9P0W5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms