Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNKQ9P0W0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFNKQ9P0W0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
IFNKQ9P0W0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms