Protein–RNA interactions for Protein: Q9P013

CWC15, Spliceosome-associated protein CWC15 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC15Q9P013 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CWC15Q9P013 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CWC15Q9P013 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CWC15Q9P013 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC15Q9P013 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC15Q9P013 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CWC15Q9P013 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.7 ms