Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHD3Q9NZN3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EHD3Q9NZN3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHD3Q9NZN3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms