Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MTMR4Q9NYA4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MTMR4Q9NYA4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MTMR4Q9NYA4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MTMR4Q9NYA4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms