Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MED29Q9NX70 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MED29Q9NX70 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MED29Q9NX70 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms