Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDIT4Q9NX09 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDIT4Q9NX09 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDIT4Q9NX09 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms