Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWM3

CUEDC1, CUE domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUEDC1Q9NWM3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC1Q9NWM3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CUEDC1Q9NWM3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC1Q9NWM3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUEDC1Q9NWM3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms