Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE7

PANK4, Pantothenate kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK4Q9NVE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PANK4Q9NVE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PANK4Q9NVE7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PANK4Q9NVE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
PANK4Q9NVE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PANK4Q9NVE7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PANK4Q9NVE7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PANK4Q9NVE7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms