Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV56

MRGBP, MRG/MORF4L-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRGBPQ9NV56 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MRGBPQ9NV56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRGBPQ9NV56 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRGBPQ9NV56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms