Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV06

DCAF13, DDB1- and CUL4-associated factor 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF13Q9NV06 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCAF13Q9NV06 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DCAF13Q9NV06 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DCAF13Q9NV06 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms