Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPTLC3Q9NUV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPTLC3Q9NUV7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC3Q9NUV7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms