Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUD5

ZCCHC3, Zinc finger CCHC domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC3Q9NUD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC3Q9NUD5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC3Q9NUD5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC3Q9NUD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms