Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CENPMQ9NSP4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CENPMQ9NSP4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPMQ9NSP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms