Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOMER3Q9NSC5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOMER3Q9NSC5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOMER3Q9NSC5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms