Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SALL1Q9NSC2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SALL1Q9NSC2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SALL1Q9NSC2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms