Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV6

PRDM10, PR domain zinc finger protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM10Q9NQV6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRDM10Q9NQV6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
PRDM10Q9NQV6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRDM10Q9NQV6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRDM10Q9NQV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms