Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EXOSC3Q9NQT5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC3Q9NQT5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EXOSC3Q9NQT5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms