Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQQ7

SLC35C2, Solute carrier family 35 member C2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C2Q9NQQ7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC35C2Q9NQQ7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC35C2Q9NQQ7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35C2Q9NQQ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms