Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MEPEQ9NQ76 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MEPEQ9NQ76 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MEPEQ9NQ76 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MEPEQ9NQ76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MEPEQ9NQ76 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEPEQ9NQ76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms