Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCUBE2Q9NQ36 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCUBE2Q9NQ36 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCUBE2Q9NQ36 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms