Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PALMDQ9NP74 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PALMDQ9NP74 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PALMDQ9NP74 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms