Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRM3Q9NNZ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRM3Q9NNZ6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRM3Q9NNZ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms