Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP4F12Q9HCS2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYP4F12Q9HCS2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYP4F12Q9HCS2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 539.3 ms