Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ2

LRRC4C, Leucine-rich repeat-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4CQ9HCJ2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LRRC4CQ9HCJ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC4CQ9HCJ2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC4CQ9HCJ2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms