Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBV1

POPDC3, Popeye domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC3Q9HBV1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POPDC3Q9HBV1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
POPDC3Q9HBV1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POPDC3Q9HBV1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POPDC3Q9HBV1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POPDC3Q9HBV1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms