Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
UPF2Q9HAU5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UPF2Q9HAU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UPF2Q9HAU5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms