Protein–RNA interactions for Protein: Q9H987

SYNPO2L, Synaptopodin 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2LQ9H987 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYNPO2LQ9H987 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SYNPO2LQ9H987 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYNPO2LQ9H987 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms