Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM38AQ9H6F2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38AQ9H6F2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM38AQ9H6F2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38AQ9H6F2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms