Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA6AQ9H2E6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMA6AQ9H2E6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms