Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX4Q9H1E5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMX4Q9H1E5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TMX4Q9H1E5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TMX4Q9H1E5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TMX4Q9H1E5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TMX4Q9H1E5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TMX4Q9H1E5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms