Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM8

NDEL1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDEL1Q9GZM8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NDEL1Q9GZM8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NDEL1Q9GZM8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NDEL1Q9GZM8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms