Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM6Q9C030 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM6Q9C030 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM6Q9C030 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms