Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM8Q9BZR9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM8Q9BZR9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM8Q9BZR9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms