Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGPP1Q9BX95 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGPP1Q9BX95 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SGPP1Q9BX95 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms