Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFT27Q9BW83 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFT27Q9BW83 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFT27Q9BW83 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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